Công tác khám chữa bệnh đạt được nhiều thành tựu đáng kể, Bệnh viện đã đề xuất và đưa vào điều trị nhiều phác đồ chuyên môn để chữa các bệnh lý khó như liệt nửa người, bệnh lý cột sống, viêm khớp cũng như các bệnh lý của thời hiện đại như tự kỷ trẻ em, hỗ trợ cắt cơn nghiện ma túy, châm tê trong phẫu thuật... Từ đó chứng minh được tính ưu việt của châm cứu và các trường phái châm cứu trong công tác điều trị bệnh.

Viện Châm cứu Trung ương được thành lập ngày 24/4/1982 theo quyết định số 369/BYT- QĐ, sau đó đổi tên thành Bệnh viện Châm cứu Trung ương năm 2003 theo QĐ 2214/ QĐ-BYT của Bộ Trưởng Bộ Y tế. Ngay từ những ngày đầu thành lập, GS Nguyễn Tài Thu – Viện trưởng Viện Châm cứu đã cùng cán bộ, nhân viên của viện vượt qua muôn vàn khó khăn, thử thách.

Từ năm 1982 cho đến nay, Bệnh viện trải qua 4 giai đoạn với 4 thế hệ lãnh đạo tiêu biểu: Cố AHLĐ.TTND.GS.TSKH Nguyễn Tài Thu (1982- 2007); PGS.TS.TTND Nghiêm Hữu Thành (2007 – 2016), PGS.TS.TTND Nguyễn Bá Quang (2016- 2019) và từ năm 2019 đến nay là PGS.TS Trần Văn Thanh. Các thế hệ lãnh đạo đã kế thừa, phát triển bệnh viện ngày càng khang trang, hiện đại, đội ngũ chuyên môn trưởng thành về mọi mặt và có nhiều cống hiến trong công tác chăm sóc và bảo vệ sức khỏe nhân dân.